肾结石疼痛在腰部、输尿管、膀胱，甚至还会造成睾丸部位出现疼痛，疼痛的时间可以长达15分钟到数小时，多数在深夜以及凌晨发作。
1、腰部疼痛：肾结石是平时生活中常见的一种肾脏疾病，当体内的肾结石体积不是很大的时候，会造成形状不规则的小石头，在肾盂输尿管部位逐渐在移动，但是在移动的过程当中，也会对患者自身的肾盂输尿管造成一定的损伤，从而诱发腰部疼痛症状。
2、输尿管疼痛：肾结石在身体内会逐渐的移动，当这些小结石移动到尿道部位，会对尿道组织造成一定损伤，短时间内可能会引起输尿管疼痛的症状。
3、膀胱疼痛：肾结石患者如果没有及时进行治疗，结石体积逐渐增大，这样会对泌尿系统造成一定的损伤，会出现感染的症状，甚至也会堵塞膀胱和尿道口，引起疼痛的症状。
4、睾丸疼痛：肾结石的患者体内的结石会慢慢的移动，如果掉到输卵管或者是尿道部位，会引起局部出现阻塞或者是堵塞，造成疼痛感，这些疼痛也会直接放射到睾丸部位，引起睾丸疼痛症状。